Die in der Karte angezeigten Daten werden nicht im Layer (*.lyr) bzw. im Kartendokument  (*.mxd) gespeichert. Er wird nur eine Beziehung zu den Daten hergestellt, die in Geodatabases, Shapefiles, Coverages, Bildern, Grids usw. enthalten sind.

Beim Öffnen eine Karte oder Laden einer Layer-Datei kann es daher vorkommen, dass GeoOffice die ursprüngliche Datenquelle für einen oder mehrere Layer nicht finden kann (so genannte Broken Links). Dies ist immer dann der Fall, wenn die Datenquelle umbenannt oder an einen anderen Ort im Dateisystem verschoben wurde bzw. wenn nach Übernahme der Daten von einem anderen Benutzer Datenquellen und Kartendokumente in einer veränderten Verzeichnisstruktur abgelegt werden.

GeoOffice express bietet verschiedene Möglichkeiten, um die unterbrochene Verbindung zwischen Layer und Datenquelle wieder herzustellen.